Ecosistemas
Los ecosistemas de Chile central se encuentran ampliamente intervenidos, debido a que la mayoría de los espacios naturales han sido ocupados y utilizados por asentamientos urbanos, muchos de ellos sin un adecuado sistema de uso y explotación de los recursos que son parte de los ecosistemas.
Dichas alteraciones afectan a todas las formas de biodiversidad, pero se observa con mayor claridad en las especies más llamativas y conspicuas de la flora y fauna de cada ecosistema.
En este contexto, no sólo es de atención el uso que se les da a los sistemas naturales, (hábitat de las más diversas formas de vida), sino que se debe destacar además, las distintas especies introducidas que forman parte de este nuevo escenario y que pueden ocasionar desplazamiento del nicho ecológico de las especies endémicas de un determinado ecosistema. En el caso particular, del ecosistema de montaña perteneciente a los sitios prioritarios Nº 4, 5 y 10, se han introducido diversas especies de fauna como el conejo, la rana africana, el gorrión, la codorniz, entre otras, mientras que en el caso de la flora se han introducido especies tales como eucaliptos, pinos y álamos, abedules, arbustos y hierbas.
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Flora y vegetación
Las plantas forman parte de nuestro patrimonio natural, y como tal resulta relevante su protección y conservación. Desde un punto de vista funcional, las plantas no viven aisladas, sino que interactúan con una serie de organismos (insectos polinizadores, herbívoros, entre otros), los que a su vez dan origen a otras interacciones en los niveles tróficos superiores. De esta manera, la flora no corresponde sólo a un listado de especies, ya que por el sólo hecho de estar presente en un área, otorga la posibilidad para que se desarrollen una serie de interacciones biológicas que dan cuenta también de la biodiversidad existente.
La riqueza de especies de la flora vascular del Cajón del Maipo, cuyo estudio se realizó a partir de bibliografía y campañas de terreno, incluye aproximadamente 450 especies. Cerca de 400 corresponden a especies nativas (endémicas y no endémicas). Utilizando el análisis realizado por otros autores para la relación superficie / riqueza en la flora de Chile mediterráneo, estos resultados muestran que el área andina del Cajón del Maipo presenta una riqueza comparativamente alta de especies nativas.
Por su parte, el nivel de endemismo de la flora andina del Cajón del Maipo, estimado en 17,2%, es sensiblemente menor a la flora vascular de Chile Central, cercano a un 50%. Este resultado, sin embargo, es esperable dado que el endemismo en la región andina disminuye en la medida que aumenta la altitud y aparece una flora compartida con Argentina.
En relación con las especies exóticas, un 12% se encuentra dentro de esta categoría. Ello da cuenta de que existe algún nivel de perturbación en las comunidades vegetales del área, producido básicamente por la ganadería, las actividades mineras e industriales (hidroeléctricas), la ocupación humana y el turismo.